More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3937 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3937  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  981    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0532  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 
360 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824059  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1699  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
312 aa  114  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  hitchhiker  0.00000021622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  28.98 
 
 
581 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0203  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
335 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2760  aminoglycoside phosphotransferase  25.97 
 
 
334 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2797  hypothetical protein  39.2 
 
 
281 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  42.06 
 
 
288 aa  94  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1653  hypothetical protein  37.41 
 
 
301 aa  93.2  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0831  hypothetical protein  35.26 
 
 
287 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0522408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0902  hypothetical protein  35.26 
 
 
287 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  37.59 
 
 
300 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2629  hypothetical protein  38.4 
 
 
299 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3021  ATPase  38.4 
 
 
299 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0667  hypothetical protein  35.97 
 
 
290 aa  91.3  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3091  hypothetical protein  41.41 
 
 
283 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.279163  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0722  hypothetical protein  38.89 
 
 
286 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0753  hypothetical protein  35.25 
 
 
290 aa  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.523032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  32.04 
 
 
294 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  36.3 
 
 
295 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0081  hypothetical protein  37.21 
 
 
279 aa  88.2  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02223  hypothetical protein  29.26 
 
 
290 aa  87.8  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.470659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3603  hypothetical protein  39.37 
 
 
290 aa  87.8  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214493  hitchhiker  0.00628158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0322  hypothetical protein  38.76 
 
 
297 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0771  hypothetical protein  36.09 
 
 
299 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0495801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  33.71 
 
 
305 aa  86.7  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3490  hypothetical protein  35.97 
 
 
318 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  39.06 
 
 
284 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0577  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3112  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0761  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0080  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2938  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0593  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  36.64 
 
 
322 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1510  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.782325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  37.32 
 
 
284 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4126  hypothetical protein  37.4 
 
 
312 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  37.5 
 
 
298 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  39.06 
 
 
284 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  39.06 
 
 
284 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  39.06 
 
 
284 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0683  hypothetical protein  38.03 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0700496  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1159  hypothetical protein  36.42 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0704  hypothetical protein  38.03 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.253725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0713  hypothetical protein  39.84 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0374  hypothetical protein  35.07 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.137383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2806  hypothetical protein  37.21 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.724657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  38.03 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2181  hypothetical protein  37.21 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0277901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2795  hypothetical protein  37.21 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0592  hypothetical protein  37.4 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178282  hitchhiker  0.00532801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0070  hypothetical protein  36.29 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2713  hypothetical protein  36.43 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2855  hypothetical protein  36.43 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.801383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  35.66 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0482  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0403  hypothetical protein  37.4 
 
 
296 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.7432  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0285  hypothetical protein  37.4 
 
 
297 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0486  hypothetical protein  37.06 
 
 
284 aa  84  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.100542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0258  hypothetical protein  37.4 
 
 
297 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639918  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6125  hypothetical protein  36.43 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.028257  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  36.43 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0350  hypothetical protein  36.23 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0520  hypothetical protein  35.94 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5422  hypothetical protein  34.93 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  37.4 
 
 
284 aa  83.2  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4338  hypothetical protein  35.9 
 
 
292 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2718  hypothetical protein  35 
 
 
294 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2355  aminoglycoside phosphotransferase  27.55 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0297  hypothetical protein  36.92 
 
 
296 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  34.31 
 
 
300 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1300  hypothetical protein  33.78 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  34.11 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  37.69 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  32.82 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3380  hypothetical protein  35.21 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  35.46 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0529  hypothetical protein  32.37 
 
 
278 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.402264  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1373  hypothetical protein  34.78 
 
 
278 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  36.36 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  34.81 
 
 
280 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  37.59 
 
 
286 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0672  hypothetical protein  32.33 
 
 
282 aa  79  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  33.81 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  35.94 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  35.66 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0906  hypothetical protein  33.77 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.960335 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  36.89 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  39.37 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  27.76 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0885  hypothetical protein  34.4 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4546  hypothetical protein  29.49 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  36.88 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  34.35 
 
 
282 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  37.23 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  34.35 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  35.88 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>