252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0529 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  563  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.402264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0081  hypothetical protein  62.59 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0771  hypothetical protein  62.09 
 
 		 299 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0495801  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  59.71 
 
 		 280 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0070  hypothetical protein  55.91 
 
 		 285 aa  321  9.000000000000001e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0350  hypothetical protein  55.82 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0258  hypothetical protein  54.92 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0403  hypothetical protein  54.42 
 
 		 296 aa  319  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.7432  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0285  hypothetical protein  54.24 
 
 		 297 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0322  hypothetical protein  55.09 
 
 		 297 aa  316  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0297  hypothetical protein  53.74 
 
 		 296 aa  311  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1915  hypothetical protein  54.67 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4126  hypothetical protein  54.74 
 
 		 312 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0592  hypothetical protein  54.39 
 
 		 297 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178282  hitchhiker  0.00532801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0520  hypothetical protein  54.39 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3112  hypothetical protein  54.39 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0761  hypothetical protein  54.39 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0080  hypothetical protein  54.39 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1510  hypothetical protein  54.39 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.782325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0577  hypothetical protein  54.39 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0593  hypothetical protein  54.39 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2938  hypothetical protein  54.39 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0482  hypothetical protein  54.04 
 
 		 297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2181  hypothetical protein  53.68 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0277901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3490  hypothetical protein  52.13 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2795  hypothetical protein  53.68 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2806  hypothetical protein  53.68 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.724657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6125  hypothetical protein  53.68 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.028257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1620  hypothetical protein  52.6 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.623458  normal  0.975454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2713  hypothetical protein  53.33 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2855  hypothetical protein  53.33 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.801383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  52.61 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1300  hypothetical protein  51.79 
 
 		 283 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4338  hypothetical protein  52.61 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5422  hypothetical protein  51.06 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1653  hypothetical protein  50.35 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1053  hypothetical protein  51.42 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0831  hypothetical protein  50.35 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0522408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0902  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0906  hypothetical protein  49.29 
 
 		 285 aa  271  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.960335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  48.24 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0374  hypothetical protein  50.69 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.137383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2797  hypothetical protein  49.12 
 
 		 281 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  48.6 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2718  hypothetical protein  48.07 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  48.77 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  46.69 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0722  hypothetical protein  47.57 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  49.47 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  49.12 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  48.76 
 
 		 282 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3091  hypothetical protein  47.75 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.279163  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  48.78 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  48.78 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  48.78 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3603  hypothetical protein  47.52 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214493  hitchhiker  0.00628158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  48.43 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  49.47 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  47.55 
 
 		 287 aa  246  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3380  hypothetical protein  47.52 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  49.47 
 
 		 285 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0713  hypothetical protein  48.78 
 
 		 284 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0704  hypothetical protein  48.43 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.253725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  48.59 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0683  hypothetical protein  48.43 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0700496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  48.43 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0867  hypothetical protein  47.37 
 
 		 285 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0486  hypothetical protein  47.5 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.100542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  47.54 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  47.89 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  47 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  46.1 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2629  hypothetical protein  46.69 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3021  ATPase  46.69 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  45.07 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  47.18 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  44.33 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  44.79 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  42.51 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  45.8 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12760  hypothetical protein  46.13 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  45.96 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0753  hypothetical protein  44.72 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.523032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  45.8 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  45.8 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  45.8 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  45.39 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  45.23 
 
 		 287 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0667  hypothetical protein  44.01 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  45.23 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4456  hypothetical protein  45.96 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4150  hypothetical protein  45.96 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  45.23 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  45.8 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  45.8 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  45.23 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  45.23 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  45.23 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  45.23 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  45.23 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>