152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2760 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2760  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
334 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2355  aminoglycoside phosphotransferase  57.01 
 
 
358 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0203  aminoglycoside phosphotransferase  53.33 
 
 
335 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0192  hypothetical protein  49.25 
 
 
344 aa  334  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2006  hypothetical protein  47.89 
 
 
333 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0264  aminoglycoside phosphotransferase  47.42 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.62236  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0235  aminoglycoside phosphotransferase  46.2 
 
 
333 aa  296  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  32.17 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  31.75 
 
 
325 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 
334 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  30.7 
 
 
363 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  30.93 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  29.68 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  31.91 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  32.55 
 
 
363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 
340 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 
363 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  31.09 
 
 
348 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3762  aminoglycoside phosphotransferase  29.35 
 
 
348 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3845  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 
348 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  31.37 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  28.66 
 
 
359 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  28.35 
 
 
338 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  27.41 
 
 
338 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  31.44 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
345 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0532  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
360 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824059  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  27.57 
 
 
338 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  26.92 
 
 
341 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  27.57 
 
 
342 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 
339 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  27.57 
 
 
342 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  32.67 
 
 
346 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 
339 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3937  hypothetical protein  25.97 
 
 
476 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 
336 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3847  aminoglycoside phosphotransferase  27.07 
 
 
347 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.899944  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  29.56 
 
 
339 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  29.56 
 
 
339 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  28.96 
 
 
368 aa  102  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
345 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 
323 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  25.74 
 
 
340 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
340 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  27.81 
 
 
350 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  27.5 
 
 
348 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  28.35 
 
 
368 aa  99.4  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  28.11 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  27.58 
 
 
365 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  25.47 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  27.86 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  26.81 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  27.27 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 
312 aa  95.9  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 
344 aa  95.9  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  25.33 
 
 
427 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  27.67 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  26.19 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  27.08 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  27.8 
 
 
379 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
332 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  28.66 
 
 
333 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  28 
 
 
504 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  26.13 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  25.3 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 
372 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  26.58 
 
 
387 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  27.84 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  26.52 
 
 
523 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  26.9 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  26.39 
 
 
340 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 
348 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  26.85 
 
 
472 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 
346 aa  89.4  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 
387 aa  89  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 
384 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  26.88 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  26.03 
 
 
360 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  26.16 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  27.15 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  27.44 
 
 
540 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  27.18 
 
 
581 aa  85.9  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
357 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  25.55 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  26.16 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>