154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0203 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0203  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
335 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2355  aminoglycoside phosphotransferase  65.97 
 
 
358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2760  aminoglycoside phosphotransferase  53.33 
 
 
334 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2006  hypothetical protein  49.85 
 
 
333 aa  325  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0192  hypothetical protein  52.53 
 
 
344 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0264  aminoglycoside phosphotransferase  48.01 
 
 
334 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.62236  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0235  aminoglycoside phosphotransferase  47.9 
 
 
333 aa  292  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  32.79 
 
 
363 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
361 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
361 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
359 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  32.04 
 
 
334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 
334 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  30.84 
 
 
351 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3762  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
348 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3845  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
348 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  32.78 
 
 
345 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  33.22 
 
 
341 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  30.99 
 
 
356 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  28.06 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  28.94 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
348 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  31.33 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 
342 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  31.47 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  28.43 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0532  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
360 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824059  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 
323 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  31.56 
 
 
348 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  32.37 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  29.52 
 
 
340 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  29.62 
 
 
338 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3847  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 
347 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.899944  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  30.28 
 
 
341 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  29.61 
 
 
344 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3937  hypothetical protein  28.62 
 
 
476 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 
379 aa  105  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 
340 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
345 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  29.62 
 
 
341 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  27.41 
 
 
379 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  28.13 
 
 
393 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  29.6 
 
 
333 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 
346 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  29.11 
 
 
350 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 
349 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
336 aa  99.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  30.15 
 
 
348 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  29.93 
 
 
401 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  29.81 
 
 
342 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  29.81 
 
 
342 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  28.42 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  27.88 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  28.34 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  29.04 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  29.04 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  29.04 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  28.21 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 
333 aa  95.9  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  28.41 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  27.75 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 
339 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  28.01 
 
 
338 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  29.09 
 
 
348 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  28.25 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  28.25 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  29.41 
 
 
472 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  27.74 
 
 
333 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  28.71 
 
 
503 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  26.87 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  29.65 
 
 
581 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  31.2 
 
 
344 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
358 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  28.68 
 
 
328 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  29.47 
 
 
363 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 
427 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  27.76 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  27.84 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  28.47 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
368 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  28.83 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>