149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2884 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
379 aa  783    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  55.53 
 
 
347 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  55.53 
 
 
361 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  55.26 
 
 
361 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  55.53 
 
 
361 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  54.69 
 
 
359 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  54.32 
 
 
351 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  54.77 
 
 
363 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  54.16 
 
 
342 aa  401  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  54.03 
 
 
363 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  53.49 
 
 
363 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  50.54 
 
 
334 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  51.72 
 
 
348 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  48.93 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  48.77 
 
 
334 aa  362  8e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  46.22 
 
 
348 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  42.65 
 
 
345 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  42.36 
 
 
346 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  38.59 
 
 
341 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  35.85 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  36.87 
 
 
325 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 
340 aa  222  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  37.33 
 
 
344 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  37.64 
 
 
330 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  35.96 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  37.36 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  37.05 
 
 
348 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  37.6 
 
 
344 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  37.26 
 
 
333 aa  210  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  34.67 
 
 
329 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  34.67 
 
 
365 aa  206  7e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  34.57 
 
 
331 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 
391 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  34.22 
 
 
341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  31.36 
 
 
312 aa  197  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  34.66 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  34.73 
 
 
372 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 
387 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  31.72 
 
 
340 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  33.79 
 
 
387 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  33.51 
 
 
348 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  33.79 
 
 
341 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  35.95 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 
336 aa  189  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  32.29 
 
 
341 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
339 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
339 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 
393 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  32.33 
 
 
339 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  33.85 
 
 
339 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  34.06 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  31.72 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  33.87 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  33.69 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  33.79 
 
 
344 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  33.79 
 
 
344 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  33.79 
 
 
344 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  33.51 
 
 
344 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  33.79 
 
 
344 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  33.79 
 
 
344 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  34.16 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  33.15 
 
 
352 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  33.69 
 
 
401 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 
368 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  32.51 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
349 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
349 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
349 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
349 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  31.32 
 
 
368 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 
388 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  32.78 
 
 
357 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  32.97 
 
 
349 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  32.62 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  32.92 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  34.37 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  33.42 
 
 
384 aa  173  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  33.42 
 
 
379 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  33.61 
 
 
344 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  32.22 
 
 
339 aa  169  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  31.69 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 
341 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  31.49 
 
 
338 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  32.53 
 
 
342 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  32.53 
 
 
342 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  31.22 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  27.2 
 
 
507 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  27.82 
 
 
507 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  30.21 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  27.93 
 
 
506 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
360 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  27.94 
 
 
506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>