149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0201 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  62.15 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  56.13 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  57.1 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  53.52 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  56.29 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  53.8 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  58.13 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  53.41 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  51.48 
 
 		 391 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  53.02 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  53.69 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  58.33 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  53.41 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  52.44 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  50.65 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  51.34 
 
 		 333 aa  339  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  55.52 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  51.14 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  53.52 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  50.73 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  48.97 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  47.67 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  47.95 
 
 		 363 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  48.68 
 
 		 348 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  48.31 
 
 		 349 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  48.31 
 
 		 349 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  48.02 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  48.02 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  48.16 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  47.74 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  47.46 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  49.85 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  49.85 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  49.24 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  49.55 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  46.55 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  49.25 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  49.25 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  49.25 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  49.25 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  49.25 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  48.04 
 
 		 341 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  52.74 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  49.67 
 
 		 338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  46.95 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  48.53 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  47.59 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  47.27 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  47.27 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  47.16 
 
 		 323 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  45.71 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  42.77 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  43.24 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  46.2 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  43.99 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  36.81 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  36.81 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  41.47 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  40 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  40 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  40.61 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  43.48 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  42.41 
 
 		 345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 		 341 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  38.48 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  38.48 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  35.62 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  40.13 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  41 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  40.67 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  41.75 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  40.67 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  40.13 
 
 		 361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  40.75 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  38.48 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  38.62 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  37.85 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  40.13 
 
 		 361 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  39.14 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  39.48 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  38.01 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  36.81 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  39.61 
 
 		 338 aa  195  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  40.46 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  40.78 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  39.35 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  41.75 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  41.75 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  40.28 
 
 		 328 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  39.02 
 
 		 358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  34.62 
 
 		 506 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  33.66 
 
 		 507 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>