150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0514 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  88.52 
 
 		 357 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  88.8 
 
 		 357 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  63.93 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  59.78 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  59.23 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  60.34 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  60.48 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  60.17 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  55.67 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  56.97 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  57.34 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  57.34 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  57.34 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  58.43 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  57.34 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  56.37 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  57.34 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  56.98 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  57.06 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  58.55 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  58.72 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  58.55 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  56.13 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  58.55 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  58.84 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  58.55 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  58.55 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  56.58 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  55.4 
 
 		 427 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  55.12 
 
 		 333 aa  364  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  56.57 
 
 		 344 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  56.74 
 
 		 387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  54.4 
 
 		 393 aa  362  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  56.74 
 
 		 387 aa  361  8e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  53.68 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  58.65 
 
 		 330 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  53.01 
 
 		 333 aa  355  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  54.89 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  54.65 
 
 		 340 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  56.4 
 
 		 333 aa  345  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  53.67 
 
 		 341 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  54.52 
 
 		 341 aa  342  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  57.23 
 
 		 340 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  51.29 
 
 		 346 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  53.69 
 
 		 338 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  51.93 
 
 		 339 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  53.1 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 339 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  49.42 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  49.42 
 
 		 339 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  49.41 
 
 		 336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  44.74 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  45.54 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  50.5 
 
 		 341 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  47.88 
 
 		 339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  47.68 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  40.36 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  40.06 
 
 		 329 aa  249  7e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  44.77 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  44.77 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  45.87 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  39.58 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  41.89 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  35.37 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  35.37 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  38.62 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  41.2 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  39.09 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 		 361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  39.09 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  40.2 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  37.72 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  38.1 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  38.87 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  37.08 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  36.5 
 
 		 379 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  39.47 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  33.15 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  42.12 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  38.6 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  41.61 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  41.61 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  37.82 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  34.1 
 
 		 505 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  32.81 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  32.93 
 
 		 504 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>