149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2712 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  95.99 
 
 
349 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  92.55 
 
 
348 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
349 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  94.56 
 
 
349 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
349 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  94.84 
 
 
349 aa  670    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  99.43 
 
 
349 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  80.8 
 
 
401 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  81.66 
 
 
344 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  81.38 
 
 
401 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  81.66 
 
 
344 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  81.66 
 
 
344 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  81.66 
 
 
344 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  81.66 
 
 
344 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  81.66 
 
 
344 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  74.18 
 
 
363 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  75.5 
 
 
348 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  73.35 
 
 
363 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  57.34 
 
 
352 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  56.34 
 
 
331 aa  371  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  55.77 
 
 
357 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  56.06 
 
 
357 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  53.39 
 
 
362 aa  352  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  53.18 
 
 
341 aa  346  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  48.55 
 
 
391 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  53.06 
 
 
360 aa  338  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  51.59 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  50.28 
 
 
427 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  52.16 
 
 
387 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  51.86 
 
 
372 aa  332  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  51.87 
 
 
387 aa  332  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  53.25 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  51.68 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  48.21 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  50.9 
 
 
333 aa  326  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  49.12 
 
 
348 aa  325  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  49.57 
 
 
346 aa  319  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  48.63 
 
 
393 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  52.63 
 
 
333 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  48.19 
 
 
333 aa  315  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  47.67 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  48.97 
 
 
338 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  48.02 
 
 
350 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  49.56 
 
 
338 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  47.11 
 
 
341 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  46.92 
 
 
339 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  46.92 
 
 
339 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  47.49 
 
 
340 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
341 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  47.8 
 
 
339 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  51.09 
 
 
340 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  46.33 
 
 
339 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  48.87 
 
 
341 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  47.87 
 
 
323 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  43.75 
 
 
336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 
340 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  43.88 
 
 
341 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  41.32 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  41.02 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  41.32 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  40.72 
 
 
361 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  42.67 
 
 
341 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  42.12 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  40.33 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  39.39 
 
 
359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  37.99 
 
 
334 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  40 
 
 
368 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  39.88 
 
 
365 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  39.57 
 
 
329 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  40.73 
 
 
339 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
363 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  38.48 
 
 
363 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
363 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  39.76 
 
 
348 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  41.74 
 
 
346 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  40.32 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  37.99 
 
 
345 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
334 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  35.95 
 
 
345 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 
348 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  36.06 
 
 
325 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  35.56 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 
342 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  36.25 
 
 
340 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
379 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
379 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  35.94 
 
 
338 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  33.86 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  42.16 
 
 
342 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  42.16 
 
 
342 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 
384 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  39.38 
 
 
344 aa  159  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  37.43 
 
 
328 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  39.11 
 
 
506 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  35.81 
 
 
505 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  36.56 
 
 
506 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 
360 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  33.96 
 
 
505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  37.04 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>