153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2843 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 332 aa  671    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  47.46 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  45.32 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  47.17 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  46.86 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  41.34 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  40.46 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 		 360 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  45.18 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  39.34 
 
 		 549 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  37.75 
 
 		 507 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 		 506 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  38.18 
 
 		 529 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  37.61 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  38.72 
 
 		 540 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  40.12 
 
 		 542 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  36.6 
 
 		 505 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  37.2 
 
 		 507 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  38.22 
 
 		 505 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  36.42 
 
 		 506 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  36.49 
 
 		 514 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  38.44 
 
 		 529 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  36.8 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  40.52 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  38.61 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  35.59 
 
 		 523 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  33.04 
 
 		 503 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  34.96 
 
 		 523 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  35.67 
 
 		 562 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  35.12 
 
 		 498 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  32.05 
 
 		 505 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  32.53 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  31.69 
 
 		 504 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  32.56 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  32.14 
 
 		 502 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  32.89 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  31.21 
 
 		 509 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  33.78 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  29.74 
 
 		 513 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  29.45 
 
 		 513 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 		 362 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  32.68 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  32.03 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  32.03 
 
 		 365 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  28.81 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  32.27 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 339 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  32.75 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  31.77 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  34.49 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  33.79 
 
 		 348 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  31.05 
 
 		 331 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 		 387 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  31.35 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  32.78 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  33.86 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  30.75 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  32.27 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  32.24 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  32.87 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  29.86 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  32.7 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  32.99 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  30.97 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  30.82 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  32.06 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  32.49 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  32.14 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  32.5 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  30.27 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 391 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 		 346 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  32.38 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  28.41 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  32.19 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  31.82 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  32.31 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  31.36 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  31.01 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  31.01 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>