252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0285 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0258  hypothetical protein  99.33 
 
 		 297 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0403  hypothetical protein  96.97 
 
 		 296 aa  587  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.7432  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0350  hypothetical protein  79.59 
 
 		 294 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0297  hypothetical protein  79.14 
 
 		 296 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0520  hypothetical protein  64.86 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0322  hypothetical protein  64.53 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2806  hypothetical protein  64.19 
 
 		 302 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.724657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2181  hypothetical protein  64.19 
 
 		 302 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0277901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2855  hypothetical protein  64.53 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.801383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2713  hypothetical protein  64.53 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2795  hypothetical protein  64.19 
 
 		 302 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540439  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6125  hypothetical protein  64.19 
 
 		 311 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.028257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0577  hypothetical protein  62.54 
 
 		 297 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0593  hypothetical protein  62.54 
 
 		 297 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3112  hypothetical protein  62.54 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0761  hypothetical protein  62.54 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0482  hypothetical protein  61.87 
 
 		 297 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4126  hypothetical protein  61.95 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0592  hypothetical protein  62.63 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178282  hitchhiker  0.00532801 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0080  hypothetical protein  62.54 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1510  hypothetical protein  62.54 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.782325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2938  hypothetical protein  62.54 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0771  hypothetical protein  57.34 
 
 		 299 aa  334  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0495801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0081  hypothetical protein  54.08 
 
 		 279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1915  hypothetical protein  54.67 
 
 		 296 aa  325  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1620  hypothetical protein  53.67 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.623458  normal  0.975454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  52.84 
 
 		 280 aa  318  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0529  hypothetical protein  54.24 
 
 		 278 aa  318  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.402264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0070  hypothetical protein  53.04 
 
 		 285 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  53.9 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3490  hypothetical protein  52.05 
 
 		 318 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4338  hypothetical protein  52.56 
 
 		 292 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1653  hypothetical protein  52.17 
 
 		 301 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0831  hypothetical protein  51.01 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0522408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0902  hypothetical protein  51.01 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5422  hypothetical protein  49.66 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1053  hypothetical protein  49.32 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0906  hypothetical protein  50.34 
 
 		 285 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.960335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1300  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  48.2 
 
 		 284 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  48.15 
 
 		 284 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  48.15 
 
 		 284 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  48.15 
 
 		 284 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0867  hypothetical protein  47.68 
 
 		 285 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  48.5 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  48.5 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  47.37 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  46.36 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  48.5 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  48.34 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  44 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  47.81 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2718  hypothetical protein  45.7 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12760  hypothetical protein  47.35 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  47.14 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  45.51 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  48.01 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  47.14 
 
 		 284 aa  252  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  47.47 
 
 		 284 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  45.85 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4150  hypothetical protein  48.34 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  47.52 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3603  hypothetical protein  48.16 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214493  hitchhiker  0.00628158 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2629  hypothetical protein  44.19 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3021  ATPase  44.19 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  47.14 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  46.33 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  47.14 
 
 		 285 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  44 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  45.33 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2797  hypothetical protein  45 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  47.18 
 
 		 287 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4456  hypothetical protein  47.68 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  44.19 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  45.82 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  45.25 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  45.25 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  43.77 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  45.39 
 
 		 284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3091  hypothetical protein  45.07 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.279163  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4546  hypothetical protein  43.48 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  45.33 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0486  hypothetical protein  45.48 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.100542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3380  hypothetical protein  44.19 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0722  hypothetical protein  44.88 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  45.64 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>