53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3342 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  35.13 
 
 
296 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  34.63 
 
 
289 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 
241 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  31.75 
 
 
246 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  32.85 
 
 
273 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  32.37 
 
 
292 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  31.27 
 
 
275 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  30.15 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  32.6 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  34.21 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  31.85 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  27.9 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  33.71 
 
 
271 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30.48 
 
 
500 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  30.15 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  30.37 
 
 
273 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  30.69 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  37.62 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  29.33 
 
 
284 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  29.18 
 
 
283 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  33.85 
 
 
283 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  36.07 
 
 
282 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  28.73 
 
 
294 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  28.31 
 
 
291 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  27.8 
 
 
298 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  30.85 
 
 
284 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  27.95 
 
 
286 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  29.03 
 
 
275 aa  99  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  32.82 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  30.56 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 
626 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  30.37 
 
 
626 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 
625 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  26.28 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  26.52 
 
 
278 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 
626 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  30.89 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  26.47 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  29.34 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  29.43 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  27.57 
 
 
245 aa  62.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  30.18 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  26.5 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  27.1 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0224  hypothetical protein  26.02 
 
 
239 aa  53.1  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.418253  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  26.18 
 
 
246 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  25.53 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1032  periplasmic solute-binding protein-like protein  23.35 
 
 
278 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  22.62 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  30.08 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>