More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2088 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  100 
 
 		 438 aa  866    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  54.38 
 
 		 475 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  58.85 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  44.33 
 
 		 423 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  44.09 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  44.09 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  44.09 
 
 		 423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  44.09 
 
 		 423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  44.09 
 
 		 423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  44.33 
 
 		 423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  43.84 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  43.84 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  42.44 
 
 		 443 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  44.36 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  44.69 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  44.69 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  41.95 
 
 		 438 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  41.71 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  44.41 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  41.78 
 
 		 436 aa  309  8e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  40.92 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  41.75 
 
 		 430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  41.09 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  41.08 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  47.27 
 
 		 424 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  40.96 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  41.99 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  41.71 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  41.34 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  41.34 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  41.99 
 
 		 438 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  42.65 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  42.65 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  42.65 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  41.34 
 
 		 442 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  42.13 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  42.65 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  42.65 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  42.65 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  42.65 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  42.65 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  42.65 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.13 
 
 		 470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  43.28 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  41.18 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  46.32 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  40.9 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  46.45 
 
 		 423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  40.57 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  46.05 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  46.05 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 442 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  46.05 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  44.02 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  46.05 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  46.05 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  42.11 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  41.73 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  45.78 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  45.78 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  42.93 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  41.27 
 
 		 439 aa  299  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  41.54 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  40.44 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  44.14 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  40.44 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  41.04 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  43.38 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  43.38 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.13 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.13 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  41.13 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  41.13 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  41.13 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  41.13 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.49 
 
 		 420 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.13 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  44.69 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.73 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  40.89 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  41.42 
 
 		 435 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  42.23 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  40.18 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  42.54 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  40.44 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  40.44 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  40.44 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  41.13 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>