More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1986 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  100 
 
 
152 aa  313  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  56 
 
 
200 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  56 
 
 
187 aa  186  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  56 
 
 
200 aa  186  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.67 
 
 
170 aa  180  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  57.43 
 
 
148 aa  180  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  57.43 
 
 
148 aa  180  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.38 
 
 
164 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  57.82 
 
 
168 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.64 
 
 
168 aa  174  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  55.78 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.3 
 
 
163 aa  169  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.03 
 
 
162 aa  168  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  52.7 
 
 
178 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.7 
 
 
167 aa  167  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  52.7 
 
 
167 aa  167  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  50.99 
 
 
169 aa  167  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  52.7 
 
 
178 aa  167  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  52.7 
 
 
178 aa  167  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  52.7 
 
 
178 aa  167  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  52.7 
 
 
178 aa  167  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  52.38 
 
 
167 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.69 
 
 
182 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  53.02 
 
 
177 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.69 
 
 
182 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54 
 
 
154 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  52.03 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.33 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.05 
 
 
164 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  53.38 
 
 
151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  52.03 
 
 
172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  52.03 
 
 
172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  52.11 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  51.35 
 
 
172 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  51.35 
 
 
172 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  51.35 
 
 
172 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.98 
 
 
176 aa  160  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.29 
 
 
411 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  54.48 
 
 
146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  56.16 
 
 
155 aa  160  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.05 
 
 
175 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  52.11 
 
 
189 aa  160  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.7 
 
 
189 aa  160  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.35 
 
 
223 aa  160  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.05 
 
 
175 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.37 
 
 
166 aa  159  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  52.35 
 
 
183 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.05 
 
 
174 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.05 
 
 
175 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  53.06 
 
 
159 aa  157  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  52.05 
 
 
222 aa  157  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  50.99 
 
 
161 aa  157  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.01 
 
 
475 aa  157  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.03 
 
 
461 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.99 
 
 
177 aa  155  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.05 
 
 
177 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.02 
 
 
231 aa  154  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  52.03 
 
 
148 aa  153  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
159 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.41 
 
 
166 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.15 
 
 
167 aa  153  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  55.3 
 
 
137 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.15 
 
 
150 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  55.63 
 
 
151 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.67 
 
 
363 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  52.67 
 
 
168 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.68 
 
 
190 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.37 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.05 
 
 
153 aa  150  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.03 
 
 
148 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
178 aa  150  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 
169 aa  150  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.38 
 
 
169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.32 
 
 
148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  50.68 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.03 
 
 
162 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  50.68 
 
 
205 aa  150  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.93 
 
 
173 aa  150  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.35 
 
 
156 aa  150  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.74 
 
 
252 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  52.86 
 
 
170 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  50.68 
 
 
165 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  44.67 
 
 
158 aa  147  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  51.37 
 
 
222 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.17 
 
 
158 aa  147  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.02 
 
 
160 aa  146  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
151 aa  146  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.52 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  46 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  52.38 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.78 
 
 
484 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.84 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  48.63 
 
 
193 aa  144  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  45.64 
 
 
195 aa  145  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  49.67 
 
 
172 aa  145  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1476  tRNA-adenosine deaminase  51.7 
 
 
176 aa  144  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  47.95 
 
 
182 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.3 
 
 
181 aa  144  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.55 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>