47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1484 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  100 
 
 
1128 aa  2244    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  44.55 
 
 
574 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  44.55 
 
 
612 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  44.91 
 
 
586 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  44.47 
 
 
577 aa  364  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  44.15 
 
 
596 aa  362  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  42.5 
 
 
841 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  41.06 
 
 
683 aa  320  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  34.53 
 
 
727 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  31.55 
 
 
1192 aa  217  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  33.27 
 
 
1236 aa  198  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  31.36 
 
 
531 aa  101  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  32.09 
 
 
514 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  28.53 
 
 
434 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  44.05 
 
 
758 aa  64.7  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1504  hypothetical protein  31.6 
 
 
279 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.487624  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  33.62 
 
 
599 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  35.43 
 
 
793 aa  61.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5227  hypothetical protein  29.96 
 
 
1394 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  41.3 
 
 
652 aa  57.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.57 
 
 
639 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  32.32 
 
 
637 aa  52.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  38.75 
 
 
604 aa  52.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  44.44 
 
 
1657 aa  52.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.84 
 
 
940 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  40.74 
 
 
1226 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  45.59 
 
 
1825 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  39.77 
 
 
551 aa  49.3  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.51 
 
 
790 aa  48.9  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  35.06 
 
 
715 aa  48.9  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  35.16 
 
 
848 aa  48.9  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36 
 
 
788 aa  47.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  41.79 
 
 
1937 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23932  predicted protein  32.8 
 
 
1009 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36 
 
 
788 aa  46.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36 
 
 
788 aa  45.8  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.19 
 
 
779 aa  45.8  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  32.91 
 
 
1951 aa  45.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.67 
 
 
788 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36 
 
 
788 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  42.47 
 
 
1117 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  45.1 
 
 
673 aa  45.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.25 
 
 
788 aa  45.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36 
 
 
788 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  38.78 
 
 
1467 aa  44.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  43.84 
 
 
1117 aa  44.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.17 
 
 
775 aa  44.7  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>