134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1043 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1043  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 448 aa  913    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  37.75 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  35.67 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  35.76 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  36.22 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  33.5 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  34.95 
 
 		 417 aa  203  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  34.87 
 
 		 417 aa  203  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  35.44 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  35.44 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  36.67 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  33.48 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  36.03 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  36.96 
 
 		 424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  35.29 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  35.31 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  34.4 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  38.46 
 
 		 439 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  38.46 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  36.01 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  36.41 
 
 		 422 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  32.48 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  32.4 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  38.17 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  37.47 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  37.03 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  34.22 
 
 		 439 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  35.29 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  35.7 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  35.38 
 
 		 420 aa  186  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  35.26 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  37.87 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  33.96 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  35.64 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  34.62 
 
 		 454 aa  183  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  36.09 
 
 		 440 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  32.9 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  37.61 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  34.78 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  38.35 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  32.38 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  36.66 
 
 		 446 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  33.26 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  37.61 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  33.49 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  31.06 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  36.13 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  33.26 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  34.78 
 
 		 426 aa  180  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  31.78 
 
 		 445 aa  179  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  34.08 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  33.64 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  33.26 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  33.76 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  39.88 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  31.87 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  39.59 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  33.26 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  31.89 
 
 		 442 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  39.59 
 
 		 422 aa  176  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  35.66 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  38.84 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  35.91 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  34.45 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  36.84 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2013  hydroxypyruvate reductase  33.1 
 
 		 395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  33.02 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  36.16 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  38.22 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  39.04 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  35.88 
 
 		 428 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  34.78 
 
 		 443 aa  173  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  32.79 
 
 		 424 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  33.33 
 
 		 446 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  33.67 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  39 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  28.94 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  35.11 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  37.27 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  37.75 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  34.4 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  36.02 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  35.2 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  35.34 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  37.65 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  38.46 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  34.43 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  36.09 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  35.75 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  38.73 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  35.85 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  33.53 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  35.93 
 
 		 448 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  34.32 
 
 		 625 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  33.1 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  35.94 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  29.84 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  36.62 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  32.03 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  33.05 
 
 		 411 aa  156  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>