35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4441 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4441  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0233309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  38.33 
 
 
353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  36.5 
 
 
319 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  39.05 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2922  hypothetical protein  35.82 
 
 
341 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3425  hypothetical protein  36.94 
 
 
298 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 
298 aa  59.3  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  27.59 
 
 
356 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  46 
 
 
423 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  46 
 
 
423 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  32.26 
 
 
381 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  46 
 
 
423 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  44 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  44.44 
 
 
424 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  31.96 
 
 
423 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  40.98 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  31.46 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1855  hypothetical protein  24.93 
 
 
382 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0573369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  29.17 
 
 
412 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  30.12 
 
 
435 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  29.57 
 
 
418 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  42 
 
 
423 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  29.14 
 
 
417 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  34.85 
 
 
455 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  37.29 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  26.81 
 
 
483 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  41.18 
 
 
437 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  26.39 
 
 
605 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  42.86 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  38.6 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  55.26 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  31.25 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  53.49 
 
 
427 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  28.03 
 
 
456 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2113  hypothetical protein  32.45 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>