56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2943 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
367 aa  750    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  34.65 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  30.79 
 
 
392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  29.76 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  31.16 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  25.44 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  25.26 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  24.9 
 
 
407 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  24.34 
 
 
426 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  23.97 
 
 
426 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  23.97 
 
 
426 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  23.97 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  23.6 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  23.46 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  29.15 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  24.14 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  25.69 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  23.34 
 
 
356 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  25.69 
 
 
413 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  24.64 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  22.86 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  22.43 
 
 
426 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  22.68 
 
 
426 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  22.96 
 
 
426 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  22.36 
 
 
426 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  22.96 
 
 
426 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  22.43 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  22.43 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  23.14 
 
 
377 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  22.43 
 
 
426 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  24.43 
 
 
435 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  21.3 
 
 
341 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  25.74 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  23.33 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  24.39 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  26.64 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.36 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  24.89 
 
 
362 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  27.23 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  23.96 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  26.91 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  23.96 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  24.49 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  23.96 
 
 
367 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  25.74 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  29.2 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  28.05 
 
 
411 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  23.64 
 
 
367 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  23.64 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  23.05 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  19.66 
 
 
745 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  24.26 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  24.22 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  27.01 
 
 
332 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  24.91 
 
 
369 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  22.86 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>