More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2524 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2524  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
279 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2804  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  85.14 
 
 
279 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0823184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36850  amino acid ABC transporter membrane protein  51.07 
 
 
288 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0547635  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.26 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.038619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3991  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.93 
 
 
307 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.824823  normal  0.27555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.45 
 
 
290 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312704  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
301 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27730  amino acid ABC transporter membrane protein  40.29 
 
 
287 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.303953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3522  amino acid ABC transporter permease  44.19 
 
 
293 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0534138  normal  0.223285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2204  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.89 
 
 
296 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1495  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
282 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0807  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  37.19 
 
 
327 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.958896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 
294 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292475  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15450  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine family  38.14 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00524032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1451  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.93 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22710  amino acid ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
297 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.23 
 
 
380 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.446629  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1122  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  45.8 
 
 
288 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal  0.228753 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1591  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.52 
 
 
313 aa  168  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30060  amino acid ABC transporter membrane protein  39.55 
 
 
277 aa  165  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1244  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3971  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.46 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2220  ABC-type amino acid transport system permease component-like protein  47.51 
 
 
312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0789  ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
361 aa  158  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1392  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.16 
 
 
325 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0423868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6296  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.26 
 
 
274 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal  0.134571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2425  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.15 
 
 
291 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4389  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
266 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223267  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1788  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
298 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0023  amino acid ABC transporter permease  38.06 
 
 
366 aa  149  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3289  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
343 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00752941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3986  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  33.69 
 
 
310 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1428  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2140  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.93 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2153  amino acid ABC transporter permease  36.93 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2199  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.93 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300415  normal  0.0164217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3754  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
266 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6370  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.85 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  40.67 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6372  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.27 
 
 
252 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198232  normal  0.40329 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.23 
 
 
216 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05400  amino acid ABC transporter transmembrane protein  35 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.669152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.5 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.1 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.51 
 
 
216 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
237 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  34.47 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  34.47 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  33.98 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  34.47 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.08 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3013  amino acid ABC transporter permease  34.29 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0715  amino acid ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
216 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.303684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  33.84 
 
 
319 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.47 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.9 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
214 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 
320 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0692  amino acid ABC transporter permease  35.92 
 
 
230 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02363  hypothetical protein  35.55 
 
 
365 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1120  ABC-type amino acid transport system, permease component  30.24 
 
 
216 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.282302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
217 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  33.84 
 
 
320 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.84 
 
 
320 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.5 
 
 
214 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4547  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
251 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.84 
 
 
320 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2586  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 
256 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2138  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.97 
 
 
366 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
214 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2069  amino acid ABC transporter permease  35.41 
 
 
506 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.76581  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0446  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  34.17 
 
 
264 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
214 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1982  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.05 
 
 
262 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.98 
 
 
559 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1135  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 
566 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.926141  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003415  amino acid ABC transporter permease protein  34.6 
 
 
365 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000100001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1527  amino acid ABC transporter, inner membrane component  34.93 
 
 
506 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229866  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0893  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 
236 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.69 
 
 
220 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.438499  normal  0.203188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
224 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  32.02 
 
 
596 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  33.17 
 
 
217 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4545  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
230 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.399321  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1514  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
217 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.78 
 
 
394 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0712  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.93 
 
 
217 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4395  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.64 
 
 
366 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.93 
 
 
217 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90786  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34670  amino acid ABC transporter membrane protein  34.6 
 
 
374 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 
591 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  34.22 
 
 
990 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  34.22 
 
 
990 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2970  amino acid ABC transporter permease  35.35 
 
 
217 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5383  amino acid ABC transporter permease  32.64 
 
 
591 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0606283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2834  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
501 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0531  ABC-type amino acid transport system, permease component  30.05 
 
 
216 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>