More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2352 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  95.52 
 
 		 357 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  70.43 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  65.45 
 
 		 357 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  69.38 
 
 		 373 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  68.98 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  70.11 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  72.17 
 
 		 361 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  66.86 
 
 		 364 aa  448  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  64.94 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  63.4 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  62.64 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  62.18 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  62.18 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  62.18 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  64.79 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  63.74 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  59.77 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  60.74 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  60.52 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  65.52 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  60.73 
 
 		 350 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  69.28 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  61.43 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  60.28 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  62.65 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  67.8 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  57.43 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  63.02 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  61.34 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  63.61 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 378 aa  364  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 356 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.6 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 355 aa  339  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  48.28 
 
 		 360 aa  338  9e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  46.39 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  46.69 
 
 		 362 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  46.96 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 361 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 361 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 355 aa  332  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 359 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  46.43 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  44.86 
 
 		 353 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  44.99 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.73 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  48.13 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  46.37 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 362 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  49.45 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  47.24 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 354 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  47.85 
 
 		 359 aa  329  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  47.09 
 
 		 361 aa  329  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  47.24 
 
 		 360 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  47.77 
 
 		 361 aa  328  7e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  47.81 
 
 		 360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  46.69 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  46.28 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 363 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  47.54 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  47.37 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>