More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0813 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0813  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
484 aa  963    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0665  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  75.98 
 
 
488 aa  731    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3562  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  57.74 
 
 
482 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2717  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  56.09 
 
 
472 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.48 
 
 
517 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904468  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37510  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  54.53 
 
 
493 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102404  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4083  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  59.05 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931282  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7133  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.54 
 
 
481 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00959772  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1577  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  49.28 
 
 
474 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.975611  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10810  oxidoreductase  47.61 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000610041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  52.61 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1337  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  48.63 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5845  mercuric reductase, truncated  50.21 
 
 
470 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.499074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0937  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.11 
 
 
493 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486491  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4489  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  48.98 
 
 
480 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0113  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.72 
 
 
505 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1076  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  49.09 
 
 
509 aa  362  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.71 
 
 
467 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0298342  normal  0.259477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.82 
 
 
499 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  39.02 
 
 
452 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.15 
 
 
448 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2073  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.29 
 
 
458 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.785339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.53 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27390  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  38.1 
 
 
546 aa  239  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.622847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2170  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.4 
 
 
445 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.39 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4442  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.96 
 
 
469 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.26 
 
 
449 aa  226  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0080326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.78 
 
 
451 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 
453 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.65246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.83 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.391833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  31.21 
 
 
507 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  33.61 
 
 
720 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2105  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  33.61 
 
 
448 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0584847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  30.43 
 
 
546 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.28 
 
 
484 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.86 
 
 
484 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.61 
 
 
469 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  31 
 
 
547 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  30.08 
 
 
479 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  32.23 
 
 
516 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.37 
 
 
484 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.65 
 
 
481 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  30.79 
 
 
547 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.63 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  29.42 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.69 
 
 
456 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  29.56 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
470 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.75 
 
 
470 aa  180  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  31.73 
 
 
486 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.39 
 
 
459 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  27.54 
 
 
460 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  31.26 
 
 
562 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.29 
 
 
585 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  30.51 
 
 
507 aa  177  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  29.76 
 
 
507 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.66 
 
 
465 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  30.67 
 
 
561 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.71 
 
 
464 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  29.85 
 
 
551 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.29 
 
 
475 aa  176  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  28 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  29.16 
 
 
510 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  30.48 
 
 
564 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.67 
 
 
460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  30.48 
 
 
564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.16 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  28 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.83 
 
 
616 aa  173  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.75 
 
 
462 aa  173  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  25.89 
 
 
460 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.52 
 
 
471 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  30.25 
 
 
561 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.22 
 
 
459 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  29 
 
 
550 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  29.79 
 
 
561 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  30.55 
 
 
510 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
492 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  30.25 
 
 
561 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  30.25 
 
 
561 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  30.25 
 
 
561 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  30.92 
 
 
767 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  32.21 
 
 
457 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
464 aa  171  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  32.31 
 
 
505 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  30.04 
 
 
561 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  29.98 
 
 
475 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  29.65 
 
 
565 aa  170  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.5 
 
 
713 aa  170  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  30.04 
 
 
561 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  29.18 
 
 
479 aa  170  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  30.33 
 
 
561 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.86 
 
 
562 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  28.83 
 
 
738 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  30.8 
 
 
561 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.09 
 
 
454 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.09 
 
 
454 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.12 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>