41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0928 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  100 
 
 
294 aa  567  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  62.88 
 
 
296 aa  332  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  58.87 
 
 
293 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  44.21 
 
 
301 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  39.77 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  45.31 
 
 
245 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  46.24 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  45.08 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  44.53 
 
 
300 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  34.88 
 
 
294 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  33.58 
 
 
327 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  37.83 
 
 
266 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  29.92 
 
 
288 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  31.62 
 
 
292 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  31.1 
 
 
316 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  30.68 
 
 
303 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  32.96 
 
 
314 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  35.66 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  32.84 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  31.32 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  32.22 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  32.1 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  26.54 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  29.15 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  28.91 
 
 
326 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  29 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  29 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0642  multi- copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component-like protein  33.75 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  28.49 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  29.41 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  29.58 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  30.43 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  30.43 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  30.43 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  30.43 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  34.25 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>