133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0253 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  100 
 
 		 603 aa  1195    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  48.54 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  45.05 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  48.16 
 
 		 544 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  43.88 
 
 		 596 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  43.79 
 
 		 588 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  44.14 
 
 		 532 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  43.74 
 
 		 550 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  43.74 
 
 		 550 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  43.74 
 
 		 550 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  46.98 
 
 		 563 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  46.08 
 
 		 538 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  44.16 
 
 		 576 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  45.36 
 
 		 605 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  42.73 
 
 		 569 aa  354  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  46.67 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  42.17 
 
 		 560 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  43.15 
 
 		 572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  43.4 
 
 		 558 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  44.71 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  42.07 
 
 		 522 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  44.59 
 
 		 598 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  40.34 
 
 		 550 aa  326  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  42.91 
 
 		 545 aa  326  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  42.61 
 
 		 539 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  43.09 
 
 		 704 aa  321  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  38.93 
 
 		 540 aa  319  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  41.9 
 
 		 532 aa  315  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  39.96 
 
 		 573 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  42.07 
 
 		 578 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  40 
 
 		 518 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  44.29 
 
 		 558 aa  289  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  41.43 
 
 		 529 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  39.71 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  39.18 
 
 		 565 aa  270  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  39.64 
 
 		 562 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  40.84 
 
 		 536 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  40.84 
 
 		 536 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  40.84 
 
 		 536 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  39.67 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  39.2 
 
 		 532 aa  257  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  38.86 
 
 		 534 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  35.79 
 
 		 548 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  24.24 
 
 		 434 aa  95.9  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  19.89 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  23.62 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  22.18 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.03 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  26.35 
 
 		 694 aa  81.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  25.05 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  23.87 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  23.09 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  21.96 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  21.46 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  23.44 
 
 		 700 aa  70.9  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  26.32 
 
 		 738 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  26.25 
 
 		 738 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  23.31 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  21.22 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  26.52 
 
 		 737 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  25.65 
 
 		 733 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  26.73 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.34 
 
 		 426 aa  67  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  26.73 
 
 		 740 aa  67  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  19.96 
 
 		 454 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  26.73 
 
 		 738 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  25.25 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  23 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  26.37 
 
 		 740 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  25.93 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  25.25 
 
 		 737 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  25.25 
 
 		 737 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  25.25 
 
 		 737 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  22.42 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  22.85 
 
 		 678 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  26.73 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  26.73 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  26.73 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  26.73 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  23.41 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  25.93 
 
 		 541 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  25.4 
 
 		 679 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  22.75 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  26.73 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  25 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  23.35 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  26.73 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.24 
 
 		 457 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  24.06 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  25.4 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  23.53 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.54 
 
 		 426 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  24.87 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  24.87 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  24.87 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  22.15 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  22.15 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  24.87 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  24.58 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  23.72 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>