190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0870 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0870  aspartate racemase  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0325955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  37.93 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  37.87 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0212  putative aspartate racemase protein  34.78 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  32.61 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1766  aspartate racemase  34.05 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  36.32 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1062  aspartate racemase  32.61 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  31.49 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000827408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  32.13 
 
 		 236 aa  128  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  35.47 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  31.06 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  31.06 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  32.9 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2506  aspartate racemase  34.62 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  31.6 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2098  aspartate racemase  34.47 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.817779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  34.21 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2053  aspartate racemase  30.17 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1127  aspartate racemase  30.6 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  0.372995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  34.38 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  32.48 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  32.48 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  35.43 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5449  aspartate racemase  30.17 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2161  aspartate racemase  30.17 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  0.822901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1249  aspartate racemase  29.82 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  31.7 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  32.47 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  33.33 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1082  aspartate racemase  33.48 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5934  aspartate racemase  30.43 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2143  aspartate racemase  30.43 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578734  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  32.47 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  33.33 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  32.62 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  32.62 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1147  aspartate racemase  30.3 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  31.6 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  33.48 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  30.64 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  30.9 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2180  aspartate racemase  30 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  29 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2760  aspartate racemase  32.91 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458115  normal  0.682156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  33.05 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  31 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  28.57 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4503  aspartate racemase  29.87 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  31.47 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2787  aspartate racemase  32.44 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0199  aspartate racemase  29.31 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  29.65 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3685  aspartate racemase  33.77 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4559  aspartate racemase  30.77 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.110424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  30.6 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3053  aspartate racemase  31.44 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4072  aspartate racemase  28.14 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  0.78132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0941  aspartate racemase  30.17 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2793  aspartate racemase  29.02 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1157  aspartate racemase  29.11 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  30 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2199  aspartate/glutamate racemase family protein  28.07 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  29.69 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  28.82 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3727  aspartate racemase  29.06 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  28.38 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  28.38 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0351  aspartate racemase  28.7 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  28.82 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2031  aspartate racemase  28.51 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0604958 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  28.38 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  28.38 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  28.82 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  28.38 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1375  aspartate racemase  30.6 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0550  aspartate racemase  30.25 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  27.51 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3286  putative racemase  29.39 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.989342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0560  aspartate racemase  30.32 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0477759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0902  aspartate racemase  30 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  27.95 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2886  hypothetical protein  30.4 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  28.45 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2977  aspartate racemase  29 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0557  aspartate racemase  30.32 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02688  predicted racemase  29.73 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0850  aspartate racemase  29.73 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02649  hypothetical protein  29.73 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4108  putative racemase  29.73 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000397336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0875  putative racemase  29.73 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3023  putative racemase  29.73 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2987  putative racemase  29.73 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3160  putative racemase  29.73 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2987  putative racemase  29.73 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3409  aspartate racemase  29.78 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1847  aspartate racemase  27.88 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.20632  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0918  aspartate racemase  30.17 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.468864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4055  aspartate racemase  27.27 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1380  aspartate racemase  27.6 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>