More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0838 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  100 
 
 
293 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  79.11 
 
 
293 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  65.12 
 
 
285 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  65.37 
 
 
281 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  63.7 
 
 
281 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  67.12 
 
 
327 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  63.35 
 
 
281 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  61.92 
 
 
287 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  52.65 
 
 
287 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  52.65 
 
 
287 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  52.3 
 
 
287 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  52.48 
 
 
289 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  48.23 
 
 
290 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  47.52 
 
 
290 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  47.87 
 
 
288 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  49.32 
 
 
369 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  47.52 
 
 
290 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  51.06 
 
 
292 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2458  ribosomal biogenesis GTPase  51.94 
 
 
288 aa  259  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  33.45 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  34.97 
 
 
283 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  35.44 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  33.56 
 
 
292 aa  178  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  32.87 
 
 
291 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  34.97 
 
 
294 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  33.45 
 
 
283 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  34.97 
 
 
294 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  32.76 
 
 
288 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  34.16 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  31.71 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  31.71 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  31.71 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  31.71 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  30.42 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  32.17 
 
 
281 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  31.36 
 
 
296 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  31.36 
 
 
296 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  31.36 
 
 
296 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  31.36 
 
 
296 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  31.71 
 
 
296 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  31.36 
 
 
296 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  31.82 
 
 
281 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  31.47 
 
 
287 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  32.5 
 
 
290 aa  169  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  32.51 
 
 
284 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  30.99 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  31.27 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  30.96 
 
 
283 aa  159  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  32.66 
 
 
292 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  30.5 
 
 
284 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.56 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  32.29 
 
 
284 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.01 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  30.58 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  32.62 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  32.27 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.27 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  31.96 
 
 
317 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  29.23 
 
 
280 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  27.24 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  29.93 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  29.64 
 
 
276 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  30.14 
 
 
318 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  30.14 
 
 
318 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 
310 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  32.4 
 
 
328 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  30.1 
 
 
315 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  32.34 
 
 
270 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  30.95 
 
 
329 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  32.53 
 
 
279 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  29.9 
 
 
314 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  28.28 
 
 
314 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  30.77 
 
 
341 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  30.24 
 
 
281 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  28.91 
 
 
323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  30.17 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  29.38 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  28.23 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  26.3 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  30.93 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  27.24 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  30 
 
 
319 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  32.06 
 
 
319 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  30 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  26.9 
 
 
312 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  32.41 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  28.57 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  27.82 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  30.14 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  26.37 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  26.71 
 
 
313 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  26.37 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  26.37 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  29.93 
 
 
305 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  30.77 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>