More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2106 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2106  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  100 
 
 
127 aa  254  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298831  normal  0.595074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2840  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  84.55 
 
 
129 aa  213  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.41626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2329  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  84.55 
 
 
129 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2848  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  76.23 
 
 
143 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2318  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  71.43 
 
 
127 aa  183  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125191  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2594  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  73.95 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3529  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  74.58 
 
 
152 aa  177  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3278  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  68.25 
 
 
128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2679  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  73.5 
 
 
118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1405  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  68.33 
 
 
140 aa  170  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2558  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  69.91 
 
 
115 aa  157  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  60.38 
 
 
116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  65.35 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  64.36 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  61.76 
 
 
110 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3131  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  53.57 
 
 
131 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2918  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  53.57 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1489  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  53.57 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2095  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  58 
 
 
108 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0602377  normal  0.0657417 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0100  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  53.57 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0817  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  56.44 
 
 
103 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0740  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  53.57 
 
 
131 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0463  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  52.07 
 
 
131 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0557  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  53.57 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  58 
 
 
108 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0572  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  53.57 
 
 
152 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  58 
 
 
108 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  58 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  54.78 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1780  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  54 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.307476  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  53.33 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2964  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  55.88 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2955  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  56.44 
 
 
115 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1701  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  53.54 
 
 
132 aa  113  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104071  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1267  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  58.16 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  52.48 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5893  nitrite reductase small subunit  50.96 
 
 
111 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1628  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  52.53 
 
 
109 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  52.88 
 
 
109 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  51.52 
 
 
114 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383279  normal  0.78464 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4524  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  51 
 
 
112 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1708  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  43.43 
 
 
113 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.78764  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  46.49 
 
 
113 aa  99.4  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  46.46 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  41.67 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  49.51 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  46.3 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  38.94 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  42.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  42.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  38.94 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  42.11 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  42.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  42.11 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2677  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  55.26 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  46.3 
 
 
109 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  40 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  41.57 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.4 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  38.54 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  38.54 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.65 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.96 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.16 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.52 
 
 
347 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.22 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  44 
 
 
346 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.05 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  31.68 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  33.67 
 
 
292 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.79 
 
 
341 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  39.13 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.58 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  45.16 
 
 
369 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  31.31 
 
 
349 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4461  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
216 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408386  normal  0.0170957 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6469  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.55 
 
 
217 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.08 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.86 
 
 
350 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4283  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0344911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  34.02 
 
 
270 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  38 
 
 
355 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
360 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
362 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.99 
 
 
526 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  34.09 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  39.68 
 
 
334 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  35 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.04 
 
 
504 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.78 
 
 
385 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  44.78 
 
 
385 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  40.79 
 
 
386 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.26 
 
 
398 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.78 
 
 
385 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>