90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1998 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1998  uroporphyrinogen III synthase  100 
 
 		 279 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2891  uroporphyrinogen-III synthase  61.23 
 
 		 272 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.328432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2378  uroporphyrinogen-III synthase  61.03 
 
 		 272 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1039  uroporphyrinogen III synthase  59.42 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1716  uroporphyrinogen III synthase  50.55 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2231  uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.32 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41378  hitchhiker  0.0093403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1375  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  50 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3089  uroporphyrinogen III synthase  47.72 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3001  uroporphyrinogen-III synthase  46.49 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00619435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0765  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.1 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000129403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.29 
 
 		 672 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.95 
 
 		 686 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.65 
 
 		 689 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.56 
 
 		 672 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.25 
 
 		 693 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.46 
 
 		 702 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2467  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.58 
 
 		 655 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.09 
 
 		 695 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 655 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1078  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.05 
 
 		 659 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1596  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.05 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2283  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.05 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3001  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.05 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1072  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.05 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0731  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.05 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1231  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.05 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0873  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.41 
 
 		 659 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.11 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.843372  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.55 
 
 		 665 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 656 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  24.01 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.6 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2428  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.82 
 
 		 656 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.475486  normal  0.299485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1812  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.82 
 
 		 656 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2424  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.82 
 
 		 656 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.69 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.9 
 
 		 672 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0870  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.18 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.787739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0657  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.81 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.9 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  28.41 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  27.4 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  28.68 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.89 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  32.64 
 
 		 513 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.52 
 
 		 513 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0281  uroporphyrinogen-III synthase  29.55 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  28.84 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  26.84 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  28.79 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  25.23 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  24.66 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  30.48 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.75 
 
 		 522 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  22.22 
 
 		 516 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4095  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.27 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3666  Na+/H+ antiporter NhaA  25 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.232778  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  28.15 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.49 
 
 		 512 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.75 
 
 		 546 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  23.47 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3902  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.33 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  27.78 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3979  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.51 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  27.67 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4134  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.74 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  25.68 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.68 
 
 		 508 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1026  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.05 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.928762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0317  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.81 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  34.55 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.07 
 
 		 509 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  23.98 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3474  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.87 
 
 		 517 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.027722  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  28.94 
 
 		 515 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  27.31 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4001  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.07 
 
 		 232 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.655634  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01301  putative uroporphyrinogen III synthase  24.07 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.69 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  23.39 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.98 
 
 		 513 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0257  uroporphyrinogen-III synthase  28.25 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.26 
 
 		 506 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01311  putative uroporphyrinogen III synthase  23.65 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  26.15 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  25.89 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  26.07 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.12 
 
 		 512 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.35 
 
 		 512 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1797  uroporphyrinogen-III synthase  22.27 
 
 		 251 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0201801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>