34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0423 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  64.47 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  64.47 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  55.56 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  51.06 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  51.82 
 
 		 147 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  56.91 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  59.5 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  40.71 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  45.11 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  44.36 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  43.65 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  40.74 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  40.74 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  43.2 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  42.86 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  42.31 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  43.2 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  43.2 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  44.44 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  43.61 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  40.8 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  38.71 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  36.8 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  41.94 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  31.09 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  37.69 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  31.15 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  28.8 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  39.66 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  39.51 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  27.13 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>