84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0314 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  71.43 
 
 
168 aa  233  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  69.01 
 
 
168 aa  233  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  65.48 
 
 
168 aa  227  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  64.52 
 
 
166 aa  202  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  42.94 
 
 
160 aa  121  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  40.4 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.84 
 
 
138 aa  91.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  37.82 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.28 
 
 
138 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.23 
 
 
137 aa  85.5  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.24 
 
 
160 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.29 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.19 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.19 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.19 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.19 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.19 
 
 
145 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.19 
 
 
145 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.19 
 
 
145 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.3 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  35.94 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  41.53 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  38.79 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  35.88 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  38.98 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  34.71 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  33.88 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  33.88 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  34.96 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  33.06 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  33.62 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  31.15 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  36.84 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  37.07 
 
 
125 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  38.02 
 
 
147 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  37.19 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  33.91 
 
 
124 aa  57.8  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.54 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  24.06 
 
 
135 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  26.72 
 
 
188 aa  50.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  30.08 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 
736 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  26.32 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  22.22 
 
 
135 aa  48.9  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 
941 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  21.8 
 
 
135 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  27.87 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  27.87 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.19 
 
 
518 aa  47.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  23.88 
 
 
135 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  19.7 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  21.31 
 
 
135 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 
133 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.6 
 
 
779 aa  44.7  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  30.66 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  30.66 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.9 
 
 
515 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3052  hemerythrin-like metal-binding protein  31.15 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129112  normal  0.291698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.95 
 
 
144 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  27.5 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.14 
 
 
515 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  22.96 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.23 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.43 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  27.64 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  29.84 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
871 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.71 
 
 
133 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  24.79 
 
 
667 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.63 
 
 
153 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.66 
 
 
1032 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1446  hemerythrin-like metal-binding protein  27.12 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  21.54 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  25.6 
 
 
145 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  22.03 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
146 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  24.71 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  23.48 
 
 
138 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>