More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0467 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0467  hypothetical protein  100 
 
 
726 aa  1498    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0916  hypothetical protein  43.19 
 
 
685 aa  553  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0756379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 
893 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  30.29 
 
 
863 aa  100  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
917 aa  99.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  30.97 
 
 
863 aa  98.6  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 
855 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 
855 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 
865 aa  97.8  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  23.31 
 
 
882 aa  96.3  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 
860 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  25.15 
 
 
853 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  25.15 
 
 
853 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  25.15 
 
 
853 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  25.15 
 
 
853 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  25.15 
 
 
853 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  25.15 
 
 
853 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  25.51 
 
 
860 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  25.15 
 
 
853 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  27.08 
 
 
867 aa  94.7  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  25.15 
 
 
853 aa  94.4  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  27.49 
 
 
903 aa  94  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 
870 aa  93.6  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  26.16 
 
 
857 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  26.38 
 
 
855 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  26 
 
 
853 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 
851 aa  93.2  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  27.95 
 
 
855 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  28.87 
 
 
900 aa  92.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  27.07 
 
 
852 aa  92.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 
896 aa  91.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.27 
 
 
536 aa  91.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.27 
 
 
536 aa  91.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  26.44 
 
 
910 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  25.96 
 
 
862 aa  91.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  29.71 
 
 
868 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  29.86 
 
 
793 aa  91.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  29.86 
 
 
793 aa  91.3  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 
855 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 
855 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 
855 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 
855 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 
857 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 
855 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  25.96 
 
 
859 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  29.53 
 
 
863 aa  90.9  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  27.64 
 
 
870 aa  90.9  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  28.07 
 
 
875 aa  90.9  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  25.81 
 
 
857 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  27.64 
 
 
870 aa  90.9  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  25.61 
 
 
870 aa  90.5  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.77 
 
 
555 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  26.81 
 
 
911 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53969  predicted protein  27.43 
 
 
1423 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 
910 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 
910 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  25.51 
 
 
854 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  31.88 
 
 
851 aa  89.7  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 
897 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  26.78 
 
 
848 aa  89.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  27.57 
 
 
881 aa  89.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  26.52 
 
 
860 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  29.14 
 
 
868 aa  89.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  22.15 
 
 
864 aa  89.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 
882 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  25.81 
 
 
880 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  28.16 
 
 
857 aa  89  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  27.46 
 
 
853 aa  89  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 
851 aa  88.6  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  25.31 
 
 
854 aa  88.6  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  29.8 
 
 
873 aa  88.6  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  27.92 
 
 
882 aa  88.6  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  30.86 
 
 
521 aa  88.6  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 
851 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  25.28 
 
 
916 aa  88.2  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  24.82 
 
 
854 aa  88.2  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  26.26 
 
 
905 aa  87.8  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  31.23 
 
 
521 aa  87.8  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  29.02 
 
 
878 aa  87.4  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  26.62 
 
 
1186 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  26.2 
 
 
851 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  26.44 
 
 
858 aa  86.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  24.32 
 
 
905 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 
882 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  32.2 
 
 
897 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  28.64 
 
 
855 aa  87  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  27.98 
 
 
859 aa  87  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 
932 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  28.43 
 
 
854 aa  86.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  34.04 
 
 
859 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  30.05 
 
 
860 aa  86.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  35.4 
 
 
882 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  33.1 
 
 
902 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  27.13 
 
 
804 aa  85.9  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  27.04 
 
 
856 aa  86.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  26.79 
 
 
956 aa  86.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  30.46 
 
 
850 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  25.31 
 
 
868 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 
939 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 
898 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>