67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1093 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1093  Rhomboid family protein  100 
 
 		 198 aa  360  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  86.87 
 
 		 198 aa  311  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  79.79 
 
 		 204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  37.78 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  30.99 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  27.78 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  37.5 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  31.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  31.49 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  34.65 
 
 		 303 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  31.76 
 
 		 280 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  38.46 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  33.86 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  24.76 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  25.81 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  29.51 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  38.1 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  28.33 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  29.84 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  39.77 
 
 		 279 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  36.47 
 
 		 277 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  36.47 
 
 		 277 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 306 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  39.77 
 
 		 290 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  26.54 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  40.74 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  34.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  30.06 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  28.48 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  34.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  34.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  34.78 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  34.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  32.1 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  26.97 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  34.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  34.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  32.95 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  32.98 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  34.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  30.7 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  27.91 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  47.37 
 
 		 360 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  28.39 
 
 		 258 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  37.38 
 
 		 369 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  35.62 
 
 		 271 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  29.84 
 
 		 280 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  34.48 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  35.56 
 
 		 204 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  29.41 
 
 		 289 aa  42  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  35 
 
 		 282 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  35.79 
 
 		 371 aa  41.6  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  35.92 
 
 		 291 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  30.2 
 
 		 162 aa  41.6  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 280 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 280 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  24.27 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 289 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 280 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  28.95 
 
 		 289 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  24.27 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  33.15 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  25 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 289 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  24.41 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>