More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1514 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  100 
 
 
343 aa  672    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  82.11 
 
 
341 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  78.59 
 
 
341 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  75.37 
 
 
340 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  54.71 
 
 
341 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  52.65 
 
 
341 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  52.35 
 
 
341 aa  349  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  53.24 
 
 
341 aa  348  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  51.76 
 
 
341 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  53.92 
 
 
340 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  52.66 
 
 
341 aa  342  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  49.56 
 
 
346 aa  338  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  51.91 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  51.51 
 
 
341 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  52.05 
 
 
345 aa  335  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  50 
 
 
341 aa  335  7e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  49.1 
 
 
342 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  52.34 
 
 
343 aa  332  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  51.62 
 
 
344 aa  332  5e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  49.7 
 
 
342 aa  332  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  50.29 
 
 
341 aa  329  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 
343 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 
343 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 
343 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  50.74 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  50.73 
 
 
342 aa  328  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  50.44 
 
 
343 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 
343 aa  325  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  47.8 
 
 
341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  48.12 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  47.35 
 
 
341 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  50.3 
 
 
342 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  46.88 
 
 
373 aa  298  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  46.58 
 
 
358 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 
340 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  45.77 
 
 
349 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  48.22 
 
 
344 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  46.33 
 
 
368 aa  295  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  46.8 
 
 
363 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 
370 aa  292  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 
365 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  46.48 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  46.46 
 
 
367 aa  288  9e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  45.87 
 
 
363 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  45.32 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  44.44 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  45.35 
 
 
378 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  41.81 
 
 
365 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  46.42 
 
 
351 aa  278  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  45.1 
 
 
339 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  45.17 
 
 
372 aa  277  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  40.96 
 
 
366 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  45.11 
 
 
375 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  46.59 
 
 
363 aa  275  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  43.96 
 
 
362 aa  275  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  42.94 
 
 
368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  44.87 
 
 
342 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  45.95 
 
 
359 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  44.6 
 
 
372 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  46.72 
 
 
356 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  45.37 
 
 
361 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  42.98 
 
 
344 aa  267  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  45.95 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  43.9 
 
 
364 aa  265  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  41.16 
 
 
372 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  42.17 
 
 
363 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  38.12 
 
 
346 aa  261  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  42.69 
 
 
342 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  43.7 
 
 
322 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  40.59 
 
 
319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  42.49 
 
 
365 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  42.98 
 
 
360 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  42.29 
 
 
369 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  43.82 
 
 
324 aa  248  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  40.64 
 
 
319 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  41.35 
 
 
362 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  39.59 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  43.24 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  41.18 
 
 
319 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  242  6e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  42.23 
 
 
322 aa  242  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  39.88 
 
 
324 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  39.44 
 
 
368 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  37.43 
 
 
328 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 
326 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  45.95 
 
 
360 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  40.23 
 
 
323 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  45.95 
 
 
360 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  40.96 
 
 
324 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  38.42 
 
 
326 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  41.76 
 
 
327 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  42.03 
 
 
359 aa  236  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  38.6 
 
 
322 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  37.24 
 
 
326 aa  236  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  39.47 
 
 
319 aa  236  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  39.3 
 
 
339 aa  235  8e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  41.35 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  40.7 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  37.24 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  40.12 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>