More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4228 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  53.83 
 
 
684 aa  673  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  100 
 
 
651 aa  1313  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  37.61 
 
 
690 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  38.63 
 
 
660 aa  357  4e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  40.15 
 
 
759 aa  356  6e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  37.86 
 
 
645 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  37.3 
 
 
660 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  41.74 
 
 
640 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  36.5 
 
 
690 aa  315  2e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  41.92 
 
 
636 aa  310  6e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  40.92 
 
 
654 aa  294  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  33.74 
 
 
662 aa  276  1e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  37.27 
 
 
634 aa  271  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  36.12 
 
 
630 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  34.46 
 
 
662 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  31.17 
 
 
665 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  39.52 
 
 
665 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  37.7 
 
 
629 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  33.1 
 
 
660 aa  259  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  36.28 
 
 
643 aa  257  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  38.01 
 
 
645 aa  256  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  37.1 
 
 
647 aa  256  1e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  32.99 
 
 
695 aa  255  2e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  35.63 
 
 
635 aa  255  2e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  37.5 
 
 
629 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  32.64 
 
 
667 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  35.05 
 
 
691 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  35.28 
 
 
662 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  32.42 
 
 
695 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  29.31 
 
 
642 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  27.92 
 
 
625 aa  247  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.94 
 
 
629 aa  246  1e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  29.22 
 
 
614 aa  239  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  31.93 
 
 
673 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.61 
 
 
632 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  32.29 
 
 
642 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  33.2 
 
 
656 aa  234  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.13 
 
 
639 aa  229  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  30.17 
 
 
647 aa  229  9e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  32.88 
 
 
660 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  33.01 
 
 
660 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  32.5 
 
 
675 aa  225  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  37.9 
 
 
656 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  35.57 
 
 
637 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  31.43 
 
 
695 aa  221  4e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  41.64 
 
 
683 aa  220  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29.07 
 
 
635 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  32.06 
 
 
658 aa  218  3e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  42.12 
 
 
679 aa  218  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  36.97 
 
 
681 aa  214  3e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  33.23 
 
 
679 aa  214  5e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  30.97 
 
 
675 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.05 
 
 
616 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.76 
 
 
690 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  32.31 
 
 
695 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  43.46 
 
 
628 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  30 
 
 
615 aa  202  2e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  44.87 
 
 
647 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  36.01 
 
 
652 aa  200  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  34.37 
 
 
638 aa  199  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  35.82 
 
 
627 aa  199  1e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  27.39 
 
 
688 aa  199  1e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.4 
 
 
657 aa  197  5e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.36 
 
 
657 aa  197  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  40.41 
 
 
644 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.39 
 
 
682 aa  195  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  39.05 
 
 
621 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  30.49 
 
 
671 aa  194  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  29.17 
 
 
715 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  27.43 
 
 
777 aa  187  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  32.94 
 
 
583 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  28.53 
 
 
720 aa  186  1e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  31.04 
 
 
711 aa  181  3e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  37.78 
 
 
718 aa  181  5e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  29.4 
 
 
626 aa  180  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  32.42 
 
 
632 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  26.18 
 
 
658 aa  179  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  30.4 
 
 
598 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  26.03 
 
 
658 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  34.67 
 
 
690 aa  176  1e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  39.71 
 
 
690 aa  176  1e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  27.97 
 
 
679 aa  175  2e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  33.8 
 
 
685 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  25.21 
 
 
675 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.63 
 
 
716 aa  168  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  34.34 
 
 
710 aa  167  6e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  34.34 
 
 
710 aa  167  6e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  34.44 
 
 
675 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  28.2 
 
 
675 aa  164  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  33.08 
 
 
678 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  40.12 
 
 
722 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  34.38 
 
 
676 aa  157  5e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  31.46 
 
 
603 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  34.01 
 
 
658 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  29.19 
 
 
760 aa  154  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  37.92 
 
 
726 aa  153  9e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  37.92 
 
 
726 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  37.92 
 
 
726 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  32.66 
 
 
671 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  33.99 
 
 
641 aa  150  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>