More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0343 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  67.95 
 
 		 506 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  67.34 
 
 		 511 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  67.55 
 
 		 506 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  68.56 
 
 		 506 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  67.14 
 
 		 506 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  100 
 
 		 497 aa  999    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  67.14 
 
 		 506 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  67.55 
 
 		 528 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  67.55 
 
 		 506 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  67.14 
 
 		 506 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2434  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  65.86 
 
 		 540 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  63.41 
 
 		 501 aa  621  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  61.09 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  61.09 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  62.88 
 
 		 500 aa  591  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1197  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  66.19 
 
 		 506 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1641  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  66.19 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0578251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0303  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  66.19 
 
 		 535 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0120484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1921  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  65.99 
 
 		 535 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0857  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  66.19 
 
 		 535 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2070  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 		 859 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1908  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  65.99 
 
 		 535 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00738158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  47.37 
 
 		 517 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  47.36 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  47.15 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  48.85 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.14 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  44.27 
 
 		 506 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  45.73 
 
 		 501 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.89 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  45.92 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.46 
 
 		 516 aa  422  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.45 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.42 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.98 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.45 
 
 		 514 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.45 
 
 		 514 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  45.36 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  45.36 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 		 523 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  45.51 
 
 		 525 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.53 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.09 
 
 		 517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.46 
 
 		 499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  45.33 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.71 
 
 		 499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  44.94 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  46.3 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  40 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 525 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.22 
 
 		 527 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  44.76 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.71 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.02 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.56 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  42.74 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.44 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.02 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  43.55 
 
 		 519 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  44.42 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  44.29 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.02 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  43.84 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  43.71 
 
 		 499 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.24 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  43.58 
 
 		 525 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.81 
 
 		 495 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.26 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  44.6 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.23 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.06 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.24 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  44.12 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.28 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.26 
 
 		 524 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.57 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  43.29 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  42.23 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.26 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  44.33 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  42.95 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.6 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  44.26 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  43.06 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  43.52 
 
 		 513 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  43.2 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  40.28 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 502 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>