More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1129 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  68.3 
 
 
691 aa  1002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  65.71 
 
 
703 aa  961  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.07544e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.14 
 
 
691 aa  686  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.72 
 
 
686 aa  706  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.07 
 
 
690 aa  707  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 
694 aa  1429  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.07 
 
 
691 aa  699  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.65 
 
 
692 aa  734  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  4.11022e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.93 
 
 
690 aa  700  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.79 
 
 
690 aa  723  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.78 
 
 
690 aa  701  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.36 
 
 
690 aa  709  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.93 
 
 
690 aa  702  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.79 
 
 
690 aa  717  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.79 
 
 
690 aa  715  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.7 
 
 
712 aa  697  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.78 
 
 
690 aa  701  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.78 
 
 
692 aa  714  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.20367e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.79 
 
 
690 aa  716  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.49 
 
 
691 aa  686  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.65 
 
 
690 aa  716  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  3.22681e-05 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  69.16 
 
 
691 aa  1013  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.94 
 
 
708 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.34 
 
 
714 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.8 
 
 
721 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.76 
 
 
714 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.49 
 
 
714 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.2 
 
 
714 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.03 
 
 
720 aa  466  1e-130  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.06 
 
 
714 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  8.38668e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.49 
 
 
714 aa  466  1e-130  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.06 
 
 
714 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  38.64 
 
 
714 aa  467  1e-130  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.86 
 
 
714 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.91 
 
 
714 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.16 
 
 
725 aa  455  1e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.26 
 
 
714 aa  452  1e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.19 
 
 
707 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  7.14427e-07 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.18 
 
 
711 aa  423  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.68 
 
 
700 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.29 
 
 
732 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.64 
 
 
726 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.64 
 
 
726 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.64 
 
 
726 aa  360  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.99 
 
 
710 aa  357  3e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.83 
 
 
716 aa  356  9e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.49 
 
 
714 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.49 
 
 
714 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.49 
 
 
714 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.35 
 
 
714 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.35 
 
 
714 aa  353  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.8 
 
 
699 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.06 
 
 
725 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.52 
 
 
699 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.23 
 
 
701 aa  343  8e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  33.66 
 
 
750 aa  343  8e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.37 
 
 
716 aa  342  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.41 
 
 
716 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  34.41 
 
 
716 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  34.41 
 
 
716 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.27 
 
 
762 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  34.41 
 
 
716 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.41 
 
 
716 aa  341  3e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.41 
 
 
716 aa  341  3e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.27 
 
 
716 aa  340  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.06 
 
 
715 aa  323  9e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.75 
 
 
692 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.54 
 
 
729 aa  315  2e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.4 
 
 
758 aa  314  4e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.68 
 
 
738 aa  310  6e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.12 
 
 
741 aa  309  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  30.25 
 
 
840 aa  280  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  32.37 
 
 
661 aa  278  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  9.73223e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  29.35 
 
 
876 aa  277  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  30.27 
 
 
822 aa  275  2e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  31.45 
 
 
659 aa  263  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  29.69 
 
 
851 aa  263  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.66591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  30 
 
 
843 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.22 
 
 
929 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  27.23 
 
 
832 aa  256  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  28.81 
 
 
838 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  30.18 
 
 
830 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.04 
 
 
921 aa  250  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.59 
 
 
930 aa  250  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  28.78 
 
 
698 aa  245  2e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  29.78 
 
 
647 aa  243  8e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  28.74 
 
 
662 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  30.01 
 
 
643 aa  238  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  28.34 
 
 
639 aa  237  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  28.24 
 
 
646 aa  235  2e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  28.61 
 
 
651 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.71 
 
 
960 aa  235  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  29.04 
 
 
709 aa  233  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  26.95 
 
 
646 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  27.75 
 
 
707 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  27.19 
 
 
664 aa  233  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.74 
 
 
957 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  31.12 
 
 
629 aa  232  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  28.12 
 
 
644 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  27.69 
 
 
846 aa  231  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>