More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0851 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  100 
 
 
256 aa  524  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  71.2 
 
 
262 aa  358  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  70.4 
 
 
262 aa  358  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  69.92 
 
 
262 aa  345  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  61 
 
 
252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  61 
 
 
253 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  61 
 
 
253 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  61 
 
 
253 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  59.75 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
252 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  58.51 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
268 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  59.75 
 
 
251 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
251 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  58.51 
 
 
252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  56.85 
 
 
252 aa  298  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  56.3 
 
 
258 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  56.19 
 
 
261 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  54.42 
 
 
264 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
276 aa  254  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  55.31 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  53.54 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  53.54 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  55.41 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  54.87 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  53.1 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  53.1 
 
 
269 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  48.5 
 
 
304 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  54.42 
 
 
257 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  54.42 
 
 
257 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  53.3 
 
 
257 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  47.64 
 
 
303 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  49.15 
 
 
293 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  48.68 
 
 
265 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  46.81 
 
 
301 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  50.4 
 
 
264 aa  240  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 
298 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  49.6 
 
 
258 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  48.9 
 
 
260 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 
298 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  52.89 
 
 
257 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  44.78 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  48.71 
 
 
259 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  44.16 
 
 
260 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  47.17 
 
 
244 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  48.07 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  44.05 
 
 
247 aa  220  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  46.46 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  45.81 
 
 
243 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  45.81 
 
 
243 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  46.67 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  43.75 
 
 
256 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  45.65 
 
 
254 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  45 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  45 
 
 
243 aa  196  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  47.3 
 
 
275 aa  194  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  37.21 
 
 
217 aa  169  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
242 aa  168  6e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.12 
 
 
231 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  37.14 
 
 
240 aa  148  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  37.14 
 
 
240 aa  148  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  34.87 
 
 
247 aa  145  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  38.33 
 
 
308 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  32.43 
 
 
256 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.92 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.92 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.92 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  34.62 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
260 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
256 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  35.87 
 
 
245 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  33.8 
 
 
254 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  35.37 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  32.3 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  36.73 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  32.3 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  36 
 
 
254 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  33.78 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  36.06 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.64 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  34.26 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  32.55 
 
 
254 aa  133  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  34.48 
 
 
271 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>