57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02852 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  64.58 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  44.38 
 
 		 192 aa  157  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  32.45 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  32.98 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  36.32 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  32.81 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  30.21 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  31.61 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  30.69 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  30.16 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  30.16 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  35.23 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  35.23 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  35.23 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  35.23 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  35.23 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  29.63 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  35.23 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  33.52 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  34.66 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  32.95 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  28.95 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  34.5 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  34.5 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  34.03 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  31.94 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  26.2 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  25.52 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  25.95 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  23.98 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  24.73 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  23.94 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  22.37 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  22.28 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  24.48 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  24.62 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  25.17 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  25.95 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  24.5 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  25.41 
 
 		 232 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  28.17 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  23.33 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  22.7 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  21.76 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  22.91 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  23.13 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  22.64 
 
 		 251 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  23.32 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>