67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003791 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  100 
 
 		 82 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  85.37 
 
 		 82 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  68.18 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  51.22 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  51.22 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  54.12 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  52.94 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  51.22 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  52.94 
 
 		 102 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  61.9 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  51.22 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  51.76 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  51.22 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  60.32 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  48.24 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  61.4 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  50.59 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  58.9 
 
 		 81 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  49.4 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  49.33 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  49.33 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  49.33 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  49.33 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  49.33 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  51.32 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  48 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  60.34 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  45.68 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  45.68 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  60.78 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  43.75 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  54 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  44.83 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  38.98 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  43.1 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  43.1 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  42.22 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  43.75 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  43.75 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  43.75 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  43.75 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  35.56 
 
 		 285 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  41.67 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  38.18 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  38.6 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  39.29 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  41.3 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.19 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  39.58 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  43.18 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  37.04 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  38.46 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  34.88 
 
 		 62 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  29.09 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  37.04 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  35.71 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  39.13 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  36 
 
 		 66 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  31.48 
 
 		 59 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  32.14 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  32.81 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  48.39 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  35.56 
 
 		 58 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>