235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003476 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  100 
 
 		 254 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  93.31 
 
 		 315 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  82.21 
 
 		 315 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  59.92 
 
 		 314 aa  314  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  56.35 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  56.35 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  57.2 
 
 		 315 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  57.2 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  57.2 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  57.2 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  56 
 
 		 316 aa  299  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  56.4 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  56.4 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  56.4 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  56.4 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  56.8 
 
 		 315 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  56.4 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  56.4 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  56.4 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  55.82 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  55.42 
 
 		 319 aa  293  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  55.2 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  55.02 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  55.82 
 
 		 320 aa  291  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  55.42 
 
 		 323 aa  288  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  52.21 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  52.21 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  52.21 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  52.21 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  52.42 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  51.39 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  51.81 
 
 		 310 aa  279  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  51 
 
 		 310 aa  275  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  52.61 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  52.4 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  50.6 
 
 		 310 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  49.6 
 
 		 309 aa  272  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  50.6 
 
 		 310 aa  272  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  49.8 
 
 		 310 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  49.8 
 
 		 310 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  49.8 
 
 		 310 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  49.8 
 
 		 310 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  49.4 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  52.21 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  48.19 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  46.99 
 
 		 311 aa  255  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  45.04 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3514  hypothetical protein  32.5 
 
 		 287 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41440  hypothetical protein  31.67 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  31.38 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1041  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2576  UspA domain-containing protein  29.88 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140838  hitchhiker  0.00089263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1103  hypothetical protein  28.29 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21994  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  28.5 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  31.44 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3550  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1103  UspA domain-containing protein  26.83 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.384617  normal  0.477468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  27.95 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3432  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 287 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.85473  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1811  UspA domain-containing protein  30.4 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0884  UspA domain-containing protein  24.24 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1169  UspA domain-containing protein  26.34 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0512262  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0988  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  26.45 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  30.04 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  33.48 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  27.65 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3296  universal stress protein  25.3 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  26.22 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  27.8 
 
 		 311 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0722  hypothetical protein  24.63 
 
 		 294 aa  99  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.483462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  27.24 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  30.42 
 
 		 326 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  31.47 
 
 		 327 aa  95.9  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0834  UspA domain protein  31.84 
 
 		 315 aa  95.1  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.652975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2103  hypothetical protein  26.07 
 
 		 293 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0483069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  27.43 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  28.99 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  25.5 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0566  hypothetical protein  30.18 
 
 		 311 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2449  hypothetical protein  30.59 
 
 		 312 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1615  UspA domain protein  29.22 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  28.07 
 
 		 318 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2169  hypothetical protein  26.5 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2306  hypothetical protein  27.52 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1119  hypothetical protein  28.03 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1915  UspA domain-containing protein  25.91 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  25.93 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  23.55 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  26.19 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  27.08 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  25.93 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3347  hypothetical protein  23.97 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1066  GGDEF  23.4 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  24.39 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1667  universal stress protein family  26.34 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3031  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>