271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003419 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  100 
 
 		 306 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  90.2 
 
 		 306 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  63.07 
 
 		 312 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  50.34 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.06 
 
 		 480 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.13 
 
 		 480 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.45 
 
 		 476 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.1 
 
 		 473 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.13 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.94 
 
 		 462 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  39.47 
 
 		 459 aa  195  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  38.72 
 
 		 459 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.41 
 
 		 479 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.43 
 
 		 487 aa  186  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.58 
 
 		 489 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  37.06 
 
 		 472 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  37.06 
 
 		 472 aa  182  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.06 
 
 		 472 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  36.46 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  36.63 
 
 		 472 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  36.4 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.76 
 
 		 528 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  34.92 
 
 		 468 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  35.34 
 
 		 473 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  35.34 
 
 		 473 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.98 
 
 		 554 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  34.96 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  34.59 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  34.59 
 
 		 457 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  34.59 
 
 		 459 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  34.59 
 
 		 457 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  35.36 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  34.96 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  39.33 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.97 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  34.44 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  34.03 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.29 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  33.83 
 
 		 457 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  33.83 
 
 		 457 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  38.72 
 
 		 464 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  33.83 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  33.83 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  33.83 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.83 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  33.83 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  33.83 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  33.83 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  33.83 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.09 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.13 
 
 		 482 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.12 
 
 		 502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  34.64 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.69 
 
 		 495 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  37.09 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  34.96 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  38.2 
 
 		 465 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  36.12 
 
 		 476 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  36.67 
 
 		 474 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.29 
 
 		 493 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  37.83 
 
 		 465 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.59 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.12 
 
 		 478 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  34.29 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.07 
 
 		 464 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.07 
 
 		 463 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.33 
 
 		 462 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.09 
 
 		 473 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.7 
 
 		 463 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.7 
 
 		 463 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  34.31 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  33.94 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  33.94 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  33.79 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  34.36 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  34.02 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  34.36 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  30.93 
 
 		 307 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  34.02 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.21 
 
 		 484 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.57 
 
 		 482 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  41.57 
 
 		 214 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  30.45 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.07 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.97 
 
 		 476 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.46 
 
 		 481 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.73 
 
 		 478 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.59 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  37.57 
 
 		 225 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.21 
 
 		 473 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.64 
 
 		 478 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  38.79 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.12 
 
 		 467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  37.95 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  36.99 
 
 		 226 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  35.24 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.6 
 
 		 480 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  37.84 
 
 		 224 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4522  siroheme synthase  31.23 
 
 		 386 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  37.08 
 
 		 212 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>