95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0336 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  433  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  45.85 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  42.44 
 
 		 206 aa  186  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  33.98 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  32.06 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  32.51 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  32.02 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  35.75 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.03 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  32.04 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  32.18 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  31.86 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  32.69 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  32.82 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  33.82 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  32.04 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  32.04 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  32.04 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  30.24 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  29.76 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  29.9 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  32.42 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  30.24 
 
 		 230 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  31.37 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  29.76 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  30.39 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  30.88 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  29.41 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  25.77 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  30.39 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  30.39 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  30.39 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  30.39 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  30.39 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  30.39 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  30.39 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.85 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  31.91 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  30.41 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  29.28 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  31.47 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  28.49 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  28.49 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  28.57 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  31.12 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  32.24 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  29.28 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  28.49 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  31.55 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  23.89 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  26.19 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  25.49 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  34.4 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  25.95 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  26.74 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  22.8 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  24.59 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  28.02 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  25.71 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  26.98 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  30.32 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  26.87 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  29.23 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  25.5 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  23.32 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  23.32 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  23.81 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  23.78 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  26.34 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  23.47 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  27.87 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  25.13 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  21.24 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  21.16 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  22.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  19.81 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  20.38 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  23.08 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  27.72 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  20.77 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  20.65 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  21.08 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>