26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0623 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  100 
 
 		 356 aa  725    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  31.41 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  31.18 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  31.52 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  29.91 
 
 		 413 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  30 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  26.94 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  28.03 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  28.74 
 
 		 361 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  26.63 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  34.48 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  27.43 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  27.57 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  27.95 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  26.48 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  27.91 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  28.13 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  26.78 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  26.55 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  31.77 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  25.81 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  30.21 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1912  DNA primase large subunit  25.07 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.424658 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  26.74 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34043  DNA-directed DNA polymerase alpha, DNA primase subunit  26.37 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43992  predicted protein  25.84 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.440471  normal  0.072463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>