23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1401 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  100 
 
 
349 aa  716    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  75.57 
 
 
349 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  68.19 
 
 
349 aa  488  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  67.62 
 
 
346 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  32.89 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  29.38 
 
 
364 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  33.09 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  26.36 
 
 
341 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  34.48 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  30.61 
 
 
364 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  26.51 
 
 
413 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  30.21 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  29.49 
 
 
338 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  28.11 
 
 
334 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  27.3 
 
 
354 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  26.65 
 
 
362 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  29.75 
 
 
361 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  36.51 
 
 
427 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  35.43 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  32.98 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  23.91 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  27.81 
 
 
389 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  31.76 
 
 
502 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>