22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2529 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  100 
 
 		 389 aa  773    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  41.97 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  42.74 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  38.75 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  40.21 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  30.89 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  29.11 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  28.46 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  26.22 
 
 		 334 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  25.8 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  24.73 
 
 		 356 aa  92.8  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  25.41 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  30.1 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  23.54 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  27.59 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  23.35 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  32.94 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  26.67 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  27.65 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  27.81 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  22.1 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  31.63 
 
 		 502 aa  53.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>