23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0880 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  100 
 
 		 413 aa  839    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  49.86 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  38.96 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  34.33 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  34.03 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  29.82 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  32.64 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  33.82 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  31.94 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  29.48 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  34.11 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  31.21 
 
 		 362 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  31.5 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  25.98 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  40.21 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  27.81 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  30.89 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  31.47 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  30.74 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  26.84 
 
 		 349 aa  117  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  25.89 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  23.05 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1246 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>