26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0993 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  100 
 
 
362 aa  736    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  65.08 
 
 
360 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  60.82 
 
 
361 aa  434  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  56.23 
 
 
427 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  40.72 
 
 
389 aa  249  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  34.69 
 
 
364 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  34.11 
 
 
413 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  36.24 
 
 
330 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  32.38 
 
 
338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  34.82 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  33.72 
 
 
334 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  31.32 
 
 
354 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  30.06 
 
 
384 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  27.17 
 
 
364 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  29.11 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  27.46 
 
 
341 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  34.17 
 
 
346 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  35.43 
 
 
349 aa  99.8  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  35.47 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  30.43 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  23.08 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  34.18 
 
 
502 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0940  DNA primase, large subunit  21.34 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00260  Subunit of DNA primase (Eurofung)  34.29 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0283839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1912  DNA primase large subunit  22.58 
 
 
307 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.424658 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1006  DNA primase, large subunit  20 
 
 
369 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>