23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0952 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  100 
 
 		 346 aa  716    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  67.53 
 
 		 349 aa  507  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  67.34 
 
 		 349 aa  489  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  67.62 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  33.78 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  31.2 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  26.73 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  29.28 
 
 		 364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  28.28 
 
 		 413 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  35.18 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  37.37 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  30.32 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  28.61 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  29.86 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  27.57 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  31.1 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  36.63 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  35.56 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  34.48 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  26.43 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  22.92 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  26.06 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  28.24 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>