24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2038 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  100 
 
 
427 aa  858    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  70.68 
 
 
360 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  58.46 
 
 
361 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  56.14 
 
 
362 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  38.96 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  34.28 
 
 
364 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  31.68 
 
 
413 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  31.41 
 
 
334 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  39.23 
 
 
330 aa  170  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  28.76 
 
 
354 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  33.47 
 
 
384 aa  152  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  37.09 
 
 
338 aa  140  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  34.63 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  28.8 
 
 
362 aa  133  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  32.28 
 
 
356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  33.64 
 
 
349 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  36.52 
 
 
349 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  34.48 
 
 
346 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  29.21 
 
 
341 aa  101  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  35.26 
 
 
349 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  19.84 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00260  Subunit of DNA primase (Eurofung)  30.43 
 
 
500 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0283839 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43992  predicted protein  24 
 
 
488 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.440471  normal  0.072463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>