26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2192 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  100 
 
 
364 aa  759    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  50.29 
 
 
413 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  46.55 
 
 
330 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  35.29 
 
 
361 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  36.72 
 
 
334 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  36.31 
 
 
360 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  31.99 
 
 
384 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  31.59 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  34.67 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  34.69 
 
 
362 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  33.14 
 
 
362 aa  176  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  41.38 
 
 
427 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  30.05 
 
 
364 aa  169  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  31.41 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  29.46 
 
 
341 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  31.2 
 
 
389 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  28.81 
 
 
349 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  30.12 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  30.14 
 
 
349 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  29.57 
 
 
346 aa  119  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  28.17 
 
 
371 aa  96.3  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  27.62 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1167  DNA primase, large subunit  34.51 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0940  DNA primase, large subunit  21.6 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1211  DNA primase, large subunit  25.37 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1006  DNA primase, large subunit  21.6 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>