29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1028 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  100 
 
 
330 aa  674    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  46.55 
 
 
364 aa  297  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  38.96 
 
 
413 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  36.13 
 
 
361 aa  210  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  35.94 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  35.33 
 
 
360 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  34.36 
 
 
354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  32.53 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  32.73 
 
 
384 aa  175  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  34.12 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  39.81 
 
 
427 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  33.13 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  27.79 
 
 
364 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  31.09 
 
 
356 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  28.95 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  33.21 
 
 
349 aa  135  9e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  29.08 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  30.64 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  28.49 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  29.49 
 
 
346 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  24.72 
 
 
371 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  24.7 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  30.95 
 
 
502 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00260  Subunit of DNA primase (Eurofung)  24.39 
 
 
500 aa  46.2  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0283839 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0940  DNA primase, large subunit  24.1 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1006  DNA primase, large subunit  27.78 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1167  DNA primase, large subunit  21.57 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1675  DNA primase large subunit  25.2 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46806  predicted protein  31.73 
 
 
463 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.67355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>