25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1462 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  100 
 
 		 334 aa  689    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  53.41 
 
 		 338 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  45.65 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  48.4 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  44.41 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  36.72 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  34.03 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  35.94 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  35.53 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  35.84 
 
 		 360 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  40.1 
 
 		 427 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  33.43 
 
 		 362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  29.26 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  29.19 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  27.35 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  35.15 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  32.01 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  28.61 
 
 		 346 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  34.62 
 
 		 349 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  24.86 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  36.94 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  21.76 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43992  predicted protein  24.35 
 
 		 488 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.440471  normal  0.072463 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1675  DNA primase large subunit  23.47 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  26.04 
 
 		 502 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>